Fundado em 1963, como resultado do trabalho de um grupo de pessoas voluntárias que sentiram a necessidade de um hospital que atendesse, no município de Registro, as pessoas que não tinham condições financeiras de manter um plano de saúde, o Hospital São João é referência regional e atende especialidades como clínica médica, cirurgia geral, ortopedia e traumatologia, otorrinolaringologia, vascular, oftalmologia e radiologia.

Mantido pela Associação de Proteção e Assistência à Maternidade e à Infância de Registro (APAMIR), de caráter filantrópico, o São João é conveniado ao Sistema Único de Saúde (SUS). Possui 44 leitos para internação SUS distribuídos entre clínica cirúrgica e obstetrícia, com enfermaria para adultos e pediatria; 07 (sete) leitos de retaguarda para pré-parto e 14 leitos de retaguarda no pronto-socorro, além de 12 (doze) leitos na ala particular. Realiza, em média, sete mil consultas e 300 internações mensais.

Em outubro de 2003, após permanecer mais de cinco meses fechado, por problemas financeiros aliados à interdição técnica promovida pelo Conselho Regional de Medicina do Estado de São Paulo (CREMESP), a Apamir firmou convenio com o CONSAÚDE, que passou a administrar o hospital.

Sob gerenciamento do CONSAÚDE, o São João entrou numa nova era, renegociando dívidas do passado sem contrair novas e ampliando paulatinamente a condições de referência regional em especialidades médicas. Logo após o convênio houve a implantação dos serviços de otorrinolaringologia, angiologia, endoscopia digestiva e radiologia, além da ampliação do ambulatório de oftalmologia.

Também houve ações complementares visando atender a demanda com ampliação do número de cirurgias eletivas de pequeno e médio porte e cirurgias vasculares; atendimento em ortopedia, ambulatorial e cirúrgico, serviço de ultra-sonografia e regularização do serviço de hemoterapia.